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微生物可预测结肠癌肿瘤突变状态

发布时间:2015-12-17 点击量:

    根据一项新的研究结果显示,肿瘤周围的微生物可用以筛查结肠癌,它比粪便潜血试验具有更高的敏感性和特异性。(2015年美国人类遗传学学会)

    明尼苏达大学的Blekhman表示,这项研究在结肠癌中很重要,因为每个肿瘤可能有不同的基因突变而表现出不同的表型,这可能对微生物造成影响。Blekhman等比较了健康的结肠细胞和来自结直肠癌患者的肿瘤细胞之间的遗传差别,发现肿瘤特异性突变与肠道中的特定细菌的存在相关。例如,存在APC基因突变的患者,与一种遗传性肿瘤综合征家族性腺瘤样息肉病密切相关,同时肿瘤周围存在丰富的梭杆菌属。Blekhman的实验室是第一个研究特定肿瘤的基因突变与肿瘤微生物群间关系的实验室。

    更多的突变,更多的多样性

    研究人员通过全基因组测序来评估44例结肠癌患者的肿瘤蛋白编码区和微生物菌群分布的特点,这些微生物菌群存在于肿瘤活检标本和正常结肠组织标本中。结果发现,若出现更多基因突变,肿瘤周围则存在更多不同的细菌种群。而对于某些基因,体细胞突变与特定微生物数量的变化有关,在信号通路水平也发现细菌与肿瘤相关的证据。肿瘤的葡萄糖运输途径的功能缺失突变与微生物能量利用水平的提高密切相关,这表明,肿瘤和其附近的细菌存在资源利用的竞争。

    研究者创建了一项风险指数,用以评价微生物与几个已知肿瘤驱动突变的相关性。该指数能够准确地预测参与编码DNA修复锌指核糖核酸酶基因ZFN717的功能缺失突变。

    这些研究结果表明,可单纯通过粪便样本对肿瘤进行基因分型,这也意味着改变肿瘤微环境可用于预防或治疗结肠癌

    埃默里大学医的Chris Gunter评论表示,该研究揭示了“隐藏的遗传问题”。若通过癌症的测序研究,可能发现10种突变,但还无法预测哪些是驱动突变哪些是被动突变。而该研究工作可以帮助医生缩小研究的范围,进而增加人们对肿瘤发生机制的了解。

    (编译 杨立峰 审校 章真)


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